به گزارش پایگاه تخصصی مسجد، روزنامه دی وولت آلمان نوشت که رجب طیب اردوغان رئیس جمهوری ترکیه در پیامی از دولت آلمان درخواست کرده تا این مسجد را تعطیل کنند. سیران آتش موسس مسجد «ابن رشد گوته»، زاده ترکیه است. وی از زمان افتتاح مسجد چندین بار به مرگ تهدید شد تا آنجا که در روزهای گذشته تحت حفاظت شدید پلیس قرار گرفته است.
رئیس مرکز امور دیانت در ترکیه نیز هفته گذشته در اظهار نظری نهاد وابسته به فتح الله گولن روحانی مخالف رجب طیب اردوغان را پشتیبان تاسیس این مسجد دانست. او همچنین گفته بود: «هدف این مسجد مخدوش کردن اصول اسلام است. مخدوش کردن اصول عبادت است.»
سخنگوی وزیر امور خارجه آلمان در واکنش به ین اظهارات، انتقادات ترکیه را نابجا خوانده بود و از آزادی مذهب و روش عبادت در آلمان دفاع کرد.
گفته می شود اردوغان قصد دارد تا زمان حضور خود در اجلاس سران گروه بیست شخصا از صدر اعظم آلمان بخواهد تا این مسجد را تعطیل کند.
انتشار تصاویر مسجد لیبرال برلین در تلویزیون و شبکه های اجتماعی، واکنش شدید مراکز دینی مصر را نیز در پی داشت. اداره فتوای مصر نماز خواندن زن و مرد در کنار یکدیگر در مسجد ابن رشد گوته را خلاف قوانین اسلام خواند.